W ramach EKO uniwersytetu dla dzieci po każdym wykładzie prowadzone są półtoragodzinne warsztaty. Te zajęcia odbywają się w siedmiu stałych grupach pod okiem prowadzących warsztaty osób: studentów i doktorantów Collegium Polonicum w Słubicach.

W warsztatach biorą udział wyłącznie studenci EKO uniwersytetu.

Podział na grupy warsztatowe:

• Grupa 1 - czerwona
• Grupa 2 - niebieska
• Grupa 3 - zielona
• Grupa 4 - pomarańczowa
• Grupa 5 - różowa
• Grupa 6 - fioletowa
• Grupa 7 - żółta